МагаданНИРО — отраслевой рыбохозяйственный институт [с 16.01.2019 г. – филиал ФГБНУ «ВНИРО» («МагаданНИРО»)], который проводит исследования водных биологических ресурсов (ВБР), главным образом, на североохотоморском побережье и в акватории Охотского моря к северу от 54º с.ш. С момента своего образования в 1959 г. институт существовал в виде регионального отделения института ТИНРО — МоТИНРО, которое в октябре 1999 г. было преобразовано в ГУП «Магаданское отделение Тихоокеанского научно-исследовательского рыбохозяйственного центра», а в октябре 2001 г. было реорганизовано в самостоятельный институт — ФГУП «МагаданНИРО». Создание отделения и его последующее преобразование в институт обосновывалось необходимостью решения ряда теоретических и научно-практических вопросов, связанных с рациональным использованием рыбной промышленностью водных биологических ресурсов региона. Изначально подконтрольная институту территория включала Магаданскую область, Чукотский автономный округ и охотоморское побережье Хабаровского края, а акватория морских работ простиралась на Чукотское, Берингово и Охотское моря.
Быстрому становлению отделения во многом способствовали энергия и организаторские способности первого директора — Марии Никифоровны Грачëвой.
Мария Никифоровна Грачева — первый директор и организатор МагаданНИРО (МоТИНРО). Руководила институтом с 1959 по 1965 гг.
Василий Леонидович Костарев Директор института с 1965 по 1997 гг.
Николай Николаевич Афанасьев возглавлял институт с 1997 по 2000 гг.
Владимир Васильевич Волобуев был директором в 2000-2001 гг.
Александр Юрьевич Рогатных возглавлял институт с 2001 по 2003 гг.
Валерий Иванович Михайлов возглавлял институт с 2003 по 2010 гг.
Марченко Сергей Леонидович возглавлял институт с 2010 по 2015 гг.
Овчинников Виктор Валерьевич возглавлял институт с 2015 по 2018 гг.
Горохов Максим Николаевич возглавлял институт с 2018 по 2022 гг.
Метелёв Евгений Александрович руководит институтом с 2022 г.
В разные периоды в структуре МагаданНИРО работало до 8-9 научных подразделений: лаборатория радиобиологии, лаборатория по изучению пресноводных водоемов, лаборатория промысловой ихтиологии, лаборатория промысловых беспозвоночных, лаборатория по изучению лососевых рыб, лаборатория по изучению морских млекопитающих, лаборатория искусственного воспроизводства лососей, Охотская ихтиологическая лаборатория.