- Лаборатория морских промысловых рыб
- Лаборатория промысловых беспозвоночных
- Лаборатория прибрежных биоресурсов
- Лаборатория лососевых экосистем
- Лаборатория искусственного воспроизводства лососей
- Лаборатория экологии рыбохозяйственных водоёмов
- Сектор анализа промыслов водных биологических ресурсов
- Сектор регистрирующих возраст структур