Минтай
Интерес рыбохозяйственной науки к изучению минтая стал проявляться в 1960-х гг. и был связан с началом интенсивного промысла этого вида, концентрирующегося для размножения в зимне-весенний период у западного побережья Камчатки. Наряду с изучением западнокамчатского минтая, велись наблюдения за минтаем, обитающим у южных Курильских островов, в заливах Анива, Терпения и у восточного Сахалина. Однако минтай северной части Охотского моря промыслом не осваивался и практически выпадал из поля зрения исследователей.
В 1973 г. Е.Я. Ёлкин приступил к изучению минтая в Притауйском районе, который в то время считался сорной рыбой, промыслом не осваивался. Получены первые сведения о его распределении и некоторых сторонах биологии в нагульный период. С 1974 г. разработка этой темы продолжена В.А. Вышегородцевым. В 1975 г. исследования по минтаю северной части Охотского моря были включены в тематический план института. В.А. Вышегородцев провел цикл работ, направленных на изучение популяционной структуры вида в северной части Охотского моря. Им было обнаружено нерестилище минтая в районе о. Ионы, выявлена морфобиологическая специфика нагульных скоплений рыб этого вида в Притауйском районе, впервые получены сведения о сезонных миграциях и особенностях распределения. Все это в совокупности позволило сделать предположение о популяционной обособленности минтая, обитающего в водах Притауйского шельфа, и целесообразности промышленного освоения его запасов. На основе рекомендаций МагаданНИРО в 1980 г. в Северо-Охотоморской подзоне развернут масштабный промысел североохотоморского стада минтая, которая к настоящему времени является одним из важнейших промысловых районов в Охотском море.
В 2000 г. В.А. Вышегородцев и А.М. Панфилов в ходе донной траловой съемки на НИС «Зодиак» получили материалы о распределении минтая в районе залива Шелихова, включая его прибрежную часть. В 2001-2002 гг. на НИС «Зодиак» В.А. Вышегородцев и Ю.К. Семенов провели специализированную траловую съемку минтая в Северо-Охотоморской подзоне.
С 2002 г. к изучению охотоморского минтая приступил С.Ю. Шершенков, который успешно применил к прогнозированию запасов и определению ОДУ минтая новый метод расчетов, основанный на предосторожном подходе. В 2003-2006 гг. С.Ю. Шершенковым было обосновано «превентивное» снижение ОДУ минтая с целью сохранения урожайных поколений и преодоления негативных тенденций в динамике запаса. В результате с 2007 г. начался рост численности минтая, что позволило С.Ю. Шершенкову обосновать изменение режима его промысла — впервые перенести часть годового вылова на осенний период. В 2008 г. по инициативе МагаданНИРО были приняты соответствующие изменения в Правила рыболовства и открыт осенний промысел в Северо-Охотоморской подзоне, что позволило уменьшить промысловый пресс на нерестового минтая и одновременно резко снизить браконьерство и его неучитываемые выбросы на промысле нагульной сельди.
В середине 2000-х гг. были проведены исследования, направленные на изучение биологии и характера распределения минтая в прибрежье. С.Ю. Шершенковым был обоснован процент ОДУ, который можно осваивать в прибрежной зоне. При этом было обосновано ведение промысла прибрежного минтая судами среднетоннажного флота (типа СТР) минтаевыми тралами. В результате этой научной работы вылов минтая в прибрежной зоне Магаданской области в 2010 г. впервые достиг объёма 4,5 тыс. т.
В 1997 г. в целях расширения судовых исследований Магаданскому отделению ТИНРО на правах хозяйственного ведения был выделен НИС «Зодиак» – тральщик типа СТР-420.
НИС «Зодиак»
Судно оборудовано двумя лабораториями для ихтиологических и гидробиологических работ и оснащено компьютерным зондом. Имеющееся океанографическое оборудование позволяет непрерывно регистрировать океанологическими зондами температуру, электропроводность, гидростатическое давление, содержание кислорода, рН, хлорофилл «а». Кроме того, после ремонта и модернизации судно дооборудовано и может работать с ловушечным промысловым вооружением, ярусом и бим-тралом.
В 1990-х гг. приоритетным направлением в тематике лаборатории промысловой ихтиологии института стал мониторинг запасов главных объектов промысла — минтая и сельди. При этом большое значение придавалось сбору количественной информации с целью оценки состояния запасов и обоснования ОДУ, разработке эффективных мер по регулированию рыболовства (Е.Я. Ёлкин, В.А. Лабецкий, В.А. Вышегородцев, В.Д. Жарникова, А.Н. Духанин, Б.П. Чевризов).
Наряду с сельдью и минтаем, регулярно проводились исследования по другим рыбным объектам промысла, в частности, по камбалам, треске, черному палтусу, наваге, мойве и другим объектам прибрежной зоны.
Л.И. Семененко были описаны морфологические и биологические особенности локальных популяций наваги. Выявлены закономерности динамики её численности, структура уловов, указаны районы возможных концентраций нагульной наваги, исходя из характера её питания и распределения бентоса в северной части Охотского моря.
Ю.А. Шилиным была обобщена информация, накопленная институтом по камбале, треске и черному палтусу за период с 1963 г. Им же неоднократно выполнялся поиск нагульных скоплений мойвы в северной части Охотского моря. К сожалению, плотных устойчивых скоплений нагульной мойвы в северной части моря обнаружить не удалось.
Исследования, проведенные в 1997 г. А.С. Лачугиным, показали, что в летний период белокорый палтус образует промысловые концентрации на глубинах от 30 до 55 м, и его можно эффективно облавливать донными ярусами.
Р.Р. Юсуповым в 2006-2009 гг. впервые проведены работы по искусственному разведению камбал в лабораторных условиях. Впервые получены данные по эмбриогенезу полярной и звездчатой камбал. В 2010 г. аналогичные исследования по треске начал А.И. Каика.